Запропоновано новий метод побудови інформаційної моделі геоінформаційної системи водних та водогосподарських об'єктів з інтеграцією баз даних, електронних карт та програмних модулів, з автоматизацією обробки даних на основі формалізації їх параметрів та методів обробки засобами ГІС-технологій, який, на відміну від існуючих, поєднує і формалізує просторові та атрибутивні дані екологічних об'єктів з урахуванням їх взаємозв'язків, що дозволяє ще на етапі проектування системи чітко визначити, які дані потрібні для її функціонування та оптимально формувати її структуру.